Υπάρχουν πολλοί τύποι στοιχείων που υποστηρίζουν τη Θεωρία της Εξέλιξης. Αυτά τα αποδεικτικά στοιχεία κυμαίνονται από το ελάχιστο μοριακό επίπεδο ομοιότητας του DNA μέχρι τις ομοιότητες εντός της ανατομικής δομής των οργανισμών. Πότε Charles Charles πρότεινε για πρώτη φορά την ιδέα του ΦΥΣΙΚΗ ΕΠΙΛΟΓΗ, χρησιμοποίησε ως επί το πλείστον στοιχεία βάσει ανατομικά χαρακτηριστικά των οργανισμών που μελέτησε.
Δύο διαφορετικοί τρόποι με τους οποίους μπορούν να ταξινομηθούν αυτές οι ομοιότητες σε ανατομικές δομές είναι και οι δύο ανάλογες δομές ή ομόλογες δομές. Ενώ και οι δύο αυτές κατηγορίες έχουν να κάνουν με το πώς χρησιμοποιούνται και δομούνται παρόμοια μέρη του σώματος διαφορετικών οργανισμών, μόνο ένα είναι στην πραγματικότητα μια ένδειξη ενός κοινού προγόνου κάπου στο παρελθόν.
Αναλογία
Η αναλογία, ή ανάλογες δομές, είναι στην πραγματικότητα αυτή που δεν δείχνει ότι υπάρχει ένας πρόσφατος κοινός πρόγονος μεταξύ δύο οργανισμών. Ακόμα κι αν οι ανατομικές δομές που μελετώνται μοιάζουν και ίσως εκτελούν τις ίδιες λειτουργίες, στην πραγματικότητα είναι προϊόν
συγκλίνουσα εξέλιξη. Ακριβώς επειδή μοιάζουν και δρουν όμοια δεν σημαίνει ότι συνδέονται στενά με το δέντρο της ζωής.Η συγκλίνουσα εξέλιξη είναι όταν δύο άσχετα είδη υφίστανται πολλές αλλαγές και προσαρμογές για να γίνουν πιο παρόμοιες. Συνήθως, αυτά τα δύο είδος ζείτε σε παρόμοια κλίματα και περιβάλλοντα σε διάφορα μέρη του κόσμου που ευνοούν τις ίδιες προσαρμογές. Τα ανάλογα χαρακτηριστικά βοηθούν στη συνέχεια τα είδη να επιβιώσουν στο περιβάλλον.
Ένα παράδειγμα ανάλογων κατασκευών είναι τα φτερά των νυχτερίδων, τα ιπτάμενα έντομα και τα πουλιά. Και οι τρεις οργανισμοί χρησιμοποιούν τα φτερά τους για να πετάξουν, αλλά τα νυχτερίδες είναι στην πραγματικότητα θηλαστικά και δεν σχετίζονται με πουλιά ή ιπτάμενα έντομα. Στην πραγματικότητα, τα πουλιά σχετίζονται στενότερα με τους δεινόσαυρους από ό, τι με τα νυχτερίδες ή τα ιπτάμενα έντομα. Πουλιά, ιπτάμενα έντομα και νυχτερίδες όλα προσαρμόστηκαν στις θέσεις τους στο περιβάλλον τους αναπτύσσοντας φτερά. Ωστόσο, τα φτερά τους δεν είναι ενδεικτικά μιας στενής εξελικτικής σχέσης.
Ένα άλλο παράδειγμα είναι τα πτερύγια σε έναν καρχαρία και ένα δελφίνι. Οι καρχαρίες ταξινομούνται στην οικογένεια των ψαριών ενώ τα δελφίνια είναι θηλαστικά. Ωστόσο, και οι δύο ζουν σε παρόμοια περιβάλλοντα στον ωκεανό όπου τα πτερύγια είναι ευνοϊκές προσαρμογές για ζώα που πρέπει να κολυμπήσουν και να μετακινηθούν στο νερό. Εάν εντοπιστούν αρκετά πίσω στο δέντρο της ζωής, τελικά θα υπάρχει ένας κοινός πρόγονος για τα δύο, αλλά δεν θα θεωρείται ένας πρόσφατος κοινός πρόγονος και ως εκ τούτου τα πτερύγια ενός καρχαρία και ενός δελφινιού θεωρούνται ανάλογες δομές.
Ομολογία
Καλείται η άλλη ταξινόμηση παρόμοιων ανατομικών δομών ομολογία. Στην ομολογία, οι ομόλογες δομές εξελίχθηκαν στην πραγματικότητα από έναν πρόσφατο κοινό πρόγονο. Οργανισμοί με ομόλογος οι δομές σχετίζονται στενότερα μεταξύ τους στο δέντρο της ζωής από εκείνες με ανάλογες δομές.
Ωστόσο, εξακολουθούν να σχετίζονται στενά με έναν πρόσφατο κοινό πρόγονο και κατά πάσα πιθανότητα έχουν υποστεί αποκλίνουσα εξέλιξη.
Η αποκλίνουσα εξέλιξη είναι όπου τα στενά συγγενικά είδη γίνονται λιγότερο παρόμοια στη δομή και τη λειτουργία λόγω των προσαρμογών που αποκτούν κατά τη διάρκεια της διαδικασίας φυσικής επιλογής. Μετανάστευση σε νέα κλίματα, ανταγωνισμός για κόγχες με άλλα είδη, και ακόμη και μικροεξελικτικές αλλαγές όπως Μεταλλάξεις DNA μπορεί να συμβάλει στην αποκλίνουσα εξέλιξη.
Ένα παράδειγμα ομολογίας είναι η ουρά στον άνθρωπο με τις ουρές των γατών και των σκύλων. Ενώ ο κόκκυξ ή η ουρά μας έχουν γίνει προφυλακτική δομή, οι γάτες και τα σκυλιά έχουν ακόμα τις ουρές τους άθικτες. Μπορεί να μην έχουμε πλέον ορατή ουρά, αλλά η δομή του κόκκυγα και των οστών στήριξης είναι πολύ παρόμοια με τα ουρά των κατοικίδιων ζώων μας.
Τα φυτά μπορούν επίσης να έχουν ομολογία. Οι φραγκοσυκιές σε έναν κάκτο και τα φύλλα σε μια βελανιδιά φαίνονται πολύ ανόμοια, αλλά στην πραγματικότητα είναι ομόλογες δομές. Έχουν ακόμη και πολύ διαφορετικές λειτουργίες. Ενώ οι κάκτοι αγκάθια προορίζονται κυρίως για προστασία και για την αποφυγή απώλειας νερού στο ζεστό και ξηρό περιβάλλον του, η βελανιδιά δεν έχει αυτές τις προσαρμογές. Και οι δύο δομές συμβάλλουν στη φωτοσύνθεση των αντίστοιχων φυτών τους, ωστόσο, έτσι δεν έχουν χαθεί όλες οι πιο πρόσφατες λειτουργίες του κοινού προγόνου. Συχνά, οι οργανισμοί με ομόλογες δομές φαίνονται πραγματικά πολύ διαφορετικοί μεταξύ τους σε σύγκριση με το πόσο κοντά μερικά είδη με ανάλογες δομές φαίνονται μεταξύ τους.