Οι γλυκοσιδικοί δεσμοί επισημαίνονται σύμφωνα με την ταυτότητα του ατόμου στον δεύτερο υδατάνθρακα ή τη λειτουργική ομάδα. Ο δεσμός που σχηματίζεται μεταξύ της ημιακετάλης ή της ημικετάλης στον πρώτο υδατάνθρακα και της υδροξυλομάδας στο δεύτερο μόριο είναι ένας Ο-γλυκοσιδικός δεσμός. Υπάρχουν επίσης Ν-, S- και C-γλυκοσιδικοί δεσμοί. Οι ομοιοπολικοί δεσμοί μεταξύ της ημιακετάλης ή της ημικετάλης με το -SR σχηματίζουν θειογλυκοσίδες. Εάν ο δεσμός είναι με το SeR, τότε σχηματίζονται σεληνογλυκοζίτες. Οι δεσμοί με το -NR1R2 είναι Ν-γλυκοζίτες. Οι δεσμοί με το -CR1R2R3 ονομάζονται C-γλυκοσίδες.
Ο όρος αγλυκόνη αναφέρεται σε οποιαδήποτε ένωση ROH από την οποία έχει αφαιρεθεί ένα υπόλειμμα υδατανθράκων, ενώ το υπόλειμμα υδατανθράκων μπορεί να αναφέρεται ως γλυκόνη. Αυτοί οι όροι εφαρμόζονται πιο συχνά σε φυσικά γλυκοζίτες.
Μπορεί επίσης να σημειωθεί ο προσανατολισμός του δεσμού. α- και β-γλυκοσιδικοί δεσμοί βασίζονται στο πιο απομακρυσμένο από το σακχαρίτη C1. Ένας α-γλυκοσιδικός δεσμός εμφανίζεται όταν και οι δύο άνθρακες μοιράζονται την ίδια στερεοχημεία. Ο β-γλυκοσιδικός δεσμός σχηματίζεται όταν οι δύο άνθρακες έχουν διαφορετική στερεοχημεία.