Ένας αριθμός δομών εντοπίζονται στη μεσεγκεφάνη, συμπεριλαμβανομένου του τεκτονίου, του τεμπεκιού, του εγκεφαλικού μαστού, της ουσίας ουσίας, κρανιακά νεύρα (οφθαλμοκινητή και τροχλερική). ο tectum αποτελείται από στρογγυλεμένες εξογκώσεις που ονομάζονται colliculi που εμπλέκονται σε διαδικασίες όρασης και ακοής. ο εγκεφαλικό μίσχο είναι μια δέσμη νευρικών ινών που συνδέουν τον πρόσθιο εγκέφαλο και τον οπίσθιο εγκέφαλο. Ο εγκεφαλικός ποδόσφαιρος περιλαμβάνει το tegementum (σχηματίζει τη βάση του μεσαίου εγκεφάλου) και τα αιματηρά εγκεφαλικά (νευρικά οστά που συνδέουν το εγκέφαλος με την παρεγκεφαλίτιδα). ο μέλαινα ουσία έχει νευρικές συνδέσεις με το μετωπικούς λοβούς και άλλες περιοχές του εγκεφάλου που εμπλέκονται στη λειτουργία του κινητήρα. Τα κύτταρα στο substantia nigra παράγουν επίσης ντοπαμίνη, έναν χημικό αγγελιοφόρο που βοηθάει στο συντονισμό μυς κίνηση.
Νευροεκφυλισμός του νευρικά κύτταρα στο substantia nigra καταλήγει σε απόρριψη της παραγωγής ντοπαμίνης. Σημαντική απώλεια των επιπέδων ντοπαμίνης (60-80%) μπορεί να οδηγήσει στην ανάπτυξη της νόσου του Parkinson. Η νόσος του Πάρκινσον είναι α
νευρικό σύστημα διαταραχή που έχει ως αποτέλεσμα την απώλεια ελέγχου και συντονισμού κινητήρα. Τα συμπτώματα περιλαμβάνουν τρόμο, βραδύτητα κίνησης, δυσκαμψία των μυών και προβλήματα με την ισορροπία.