Δεν απορροφώνται όλα τα μήκη κύματος του φωτός κατά τη φωτοσύνθεση. Το πράσινο, το χρώμα των περισσότερων φυτών, είναι στην πραγματικότητα το χρώμα που αντανακλάται. Το φως που απορροφάται χωρίζει το νερό σε υδρογόνο και οξυγόνο:
Οι σκοτεινές αντιδράσεις δεν απαιτούν φως, αλλά δεν εμποδίζονται από αυτό. Για τα περισσότερα φυτά, οι σκοτεινές αντιδράσεις λαμβάνουν χώρα κατά τη διάρκεια της ημέρας. Η σκοτεινή αντίδραση εμφανίζεται στο στρώμα του χλωροπλάστη. Αυτή η αντίδραση ονομάζεται σταθεροποίηση άνθρακα ή το Κύκλος Calvin. Σε αυτήν την αντίδραση, το διοξείδιο του άνθρακα μετατρέπεται σε σάκχαρο χρησιμοποιώντας ATP και NADPH. Το διοξείδιο του άνθρακα συνδυάζεται με μια ζάχαρη 5-άνθρακα για να σχηματίσει μια ζάχαρη 6-άνθρακα. Το σάκχαρο 6-άνθρακα χωρίζεται σε δύο μόρια σακχάρου, τη γλυκόζη και τη φρουκτόζη, τα οποία μπορούν να χρησιμοποιηθούν για την παραγωγή σακχαρόζης. Η αντίδραση απαιτεί 72 φωτόνια φωτός.
Η αποτελεσματικότητα της φωτοσύνθεσης περιορίζεται από περιβαλλοντικούς παράγοντες, όπως το φως, το νερό και το διοξείδιο του άνθρακα. Σε ζεστό ή ξηρό καιρό, τα φυτά ενδέχεται να κλείσουν τα στομάτα τους για να εξοικονομήσουν νερό. Όταν τα στομάτα είναι κλειστά, τα φυτά ενδέχεται να ξεκινήσουν τη φωτοαναπνοή. Τα φυτά που ονομάζονται φυτά C4 διατηρούν υψηλά επίπεδα διοξειδίου του άνθρακα μέσα στα κύτταρα που παράγουν γλυκόζη, για να αποφευχθεί η φωτοαναπνοή. Τα φυτά C4 παράγουν υδατάνθρακες πιο αποτελεσματικά από τα κανονικά φυτά C3, υπό την προϋπόθεση ότι το διοξείδιο του άνθρακα είναι περιοριστικό και υπάρχει αρκετό φως για να υποστηρίξει την αντίδραση. Σε μέτριες θερμοκρασίες, υπερβολικά μεγάλο μέρος της ενεργειακής επιβάρυνσης τοποθετείται στα εργοστάσια για να κάνει τη στρατηγική C4 αξιόλογη (ονομάζεται 3 και 4 λόγω του αριθμού των άνθρακα στην ενδιάμεση αντίδραση). Τα φυτά C4 ευδοκιμούν σε ζεστά, ξηρά κλίματα. Ερωτήσεις μελέτης
Ακολουθούν μερικές ερωτήσεις που μπορείτε να κάνετε στον εαυτό σας, για να σας βοηθήσουμε να προσδιορίσετε εάν κατανοείτε πραγματικά τα βασικά του τρόπου λειτουργίας της φωτοσύνθεσης.