Το ενδοπλασματικό δίκτυο (ER) είναι σημαντικό organelle σε ευκαρυωτικά κύτταρα. Διαδραματίζει σημαντικό ρόλο στην παραγωγή, επεξεργασία και μεταφορά του πρωτεΐνες και λιπίδια. Το ER παράγει διαμεμβρανικές πρωτεΐνες και λιπίδια για τη μεμβράνη του και πολλά άλλα συστατικά του κυττάρου συμπεριλαμβανομένων λυσοσώματα, εκκριτικά κυστίδια, το Golgi appatatus, ο κυτταρική μεμβράνη, και φυτικά κελιά φυτικών κυττάρων.
Οι δύο περιοχές του ΚΕ διαφέρουν τόσο ως προς τη δομή όσο και ως προς τη λειτουργία τους. Έχει τραχύ ER ριβοσωμάτων προσαρτημένο στην κυτταροπλασματική πλευρά της μεμβράνης. Το ομαλό ER στερείται συνδεδεμένων ριβοσωμάτων. Συνήθως, το ομαλό ER είναι ένα δίκτυο σωληναρίων και το τραχύ ER είναι μια σειρά πεπλατυσμένων σάκων.
Ο χώρος μέσα στο ER ονομάζεται lumen. Το ER είναι πολύ εκτεταμένο και εκτείνεται από το κυτταρική μεμβράνη μέσα από κυτόπλασμα και σχηματίζοντας μια συνεχή σύνδεση με το πυρηνικό φάκελο. Δεδομένου ότι το ER είναι συνδεδεμένο με τον πυρηνικό φάκελο, ο αυλός του ER και ο χώρος μέσα στον πυρηνικό φάκελο είναι μέρος του ίδιου διαμερίσματος.
Το τραχύ ενδοπλασματικό δίκτυο κατασκευάζει μεμβράνες και εκκριτικό πρωτεΐνες. ο ριβοσωμάτων που συνδέονται με το τραχύ ER συνθέτουν πρωτεΐνες με τη διαδικασία του μετάφραση. Σε ορισμένες λευκοκύτταρα (λευκά αιμοσφαίρια), το τραχύ ER παράγει αντισώματα. Σε παγκρεατικά κύτταρα, το τραχύ ER παράγει ινσουλίνη.
Το τραχύ και ομαλό ER είναι συνήθως διασυνδεδεμένο και οι πρωτεΐνες και οι μεμβράνες που κατασκευάζονται από το τραχύ ER μετακινούνται στο ομαλό ER για να μεταφερθούν σε άλλες θέσεις. Μερικές πρωτεΐνες αποστέλλονται στη συσκευή Golgi με ειδικά κυστίδια μεταφοράς. Αφού οι πρωτεΐνες τροποποιηθούν στο Golgi, μεταφέρονται στους σωστούς προορισμούς τους μέσα στο κύτταρο ή εξάγονται από το κελί εξωκυττάρωση.
Στα ηπατικά κύτταρα το ομαλό ER παράγει ένζυμα που βοηθούν στην αποτοξίνωση ορισμένων ενώσεων. Σε μυς το ομαλό ER βοηθά στη συστολή των μυϊκών κυττάρων και στο εγκέφαλος κυττάρων που συνθέτουν αρσενικά και θηλυκά ορμόνες.